Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms