Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD2AQ9BW72 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms