Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms