Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDHD3Q9BSH5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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HDHD3Q9BSH5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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HDHD3Q9BSH5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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HDHD3Q9BSH5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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HDHD3Q9BSH5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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HDHD3Q9BSH5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HDHD3Q9BSH5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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