Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms