Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3GL3Q99963 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms