Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms