Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms