Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms