Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS6KC1Q96S38 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 588.9 ms