Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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