Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COG3Q96JB2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms