Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MVB12AQ96EY5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms