Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms