Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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UBE2E3Q969T4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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UBE2E3Q969T4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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