Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NKD1Q969G9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NKD1Q969G9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NKD1Q969G9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms