Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ZNF248Q8NDW4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF248Q8NDW4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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