Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HJURPQ8NCD3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms