Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms