Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms