Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC84Q86UT8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms