Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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