Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEM1Q6ZVN7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms