Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC141Q6ZP82 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC141Q6ZP82 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms