Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMARCD3Q6STE5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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