Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FRMPD1Q5SYB0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms