Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms