Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP7Q16576 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms