Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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