Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CARTPTQ16568 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CARTPTQ16568 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms