Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CDSNQ15517 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CDSNQ15517 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CDSNQ15517 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CDSNQ15517 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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CDSNQ15517 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CDSNQ15517 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CDSNQ15517 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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