Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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