Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms