Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CUL3Q13618 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CUL3Q13618 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CUL3Q13618 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CUL3Q13618 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CUL3Q13618 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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