Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MTMR3Q13615 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms