Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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PEX6Q13608 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PEX6Q13608 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PEX6Q13608 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PEX6Q13608 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PEX6Q13608 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PEX6Q13608 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PEX6Q13608 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PEX6Q13608 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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PEX6Q13608 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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PEX6Q13608 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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