Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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