Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDAC1Q13547 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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