Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PPP1R1AQ13522 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms