Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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