Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LSAMPQ13449 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 310.6 ms