Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CCNG2-205ENST00000509972 1549 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 LINC00879-205ENST00000470465 757 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SAA2-203ENST00000526900 687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 IRAK4-202ENST00000440781 1409 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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