Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IFT88Q13099 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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