Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
STRN3Q13033 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STRN3Q13033 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms