Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NFX1Q12986 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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