Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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