Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCB1Q12824 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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