Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms