Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms