Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
PSME1Q06323 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSME1Q06323 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms